Расшифровка: насколько опасны варианты Covid

Группа российских исследователей раскрыла механизмы появления новых и опасных вариантов вируса Короны, таких как Альфа, Дельта, Омикрон и другие.

Группа под руководством сотрудников Национального исследовательского университета «Высшая школа экономики» (НИУ ВШЭ) обнаружила, что вероятность возникновения замены в том или ином участке генома SARS-CoV-2 зависит от наличия совместимых замен в других участках.

Это объясняет, почему новые и более заразные варианты вируса появились неожиданно и существенно отличаются от ранее циркулировавших, пишут в статье, опубликованной в журнале eLife.

Все вирусы изменяются со временем, включая вирус SARS-CoV-2, ответственный за пандемию коронавируса. Чем дольше вирус циркулирует в популяции и чем больше зараженных им особей, тем больше изменений (мутаций) он накапливает. Новые штаммы вируса обычно аналогичны своим родительским штаммам.

Однако в некоторых случаях мутации могут привести к вариантам, которые лучше адаптированы к окружающей среде и представляют больший риск для здоровья человека. Эти варианты имеют тенденцию к более быстрому распространению, могут не реагировать на существующие вакцины или методы лечения, и их может быть труднее диагностировать.

«Эволюцию вируса в сообществе можно уподобить путешествию по обширной местности с долинами, ущельями и холмами. Вирус беспорядочно блуждает по этому ландшафту, быстро умирает, если попадает в полость, и дольше живет в долинах». — рассказал Алексей Неверов из Международной лаборатории статистической геномики НИУ ВШЭ.И бухгалтер:

Для исследования команда проанализировала более трех миллионов геномных последовательностей различных штаммов SARS-CoV-2. Они определили определенные места на поверхности белка коронавируса, где произошли аминокислотные замены, отличая варианты как от исходного штамма Ухань, так и друг от друга.

Многие из этих сайтов, по-видимому, развиваются согласованно, так что за изменениями аминокислот в одном сайте быстро следуют изменения в другом. Все активные и вирулентные варианты вируса отличались от ранее доминирующих вариантов наличием множественных замен.

«Люди с длительным течением COVID-19 могут иметь накопление вариантов, которые плохо приспособлены для выживания в общей популяции. Однако со временем эти варианты могут эволюционировать в более сильные формы, которые могут широко распространяться и вторгаться». Мир Неверов объяснил.

Команда предлагает объяснение, почему промежуточные варианты, отличающиеся от исходного вируса всего одной или двумя заменами, не появляются. Возможно, что эти «слабые» варианты станут «сильными» только тогда, когда вы объедините полную картину индивидуально вредных замен. В результате, по словам исследователей, трудно предсказать появление нового высокоадаптивного штамма.

Статистический метод, используемый авторами исследования, универсален и может быть использован для изучения эволюции многих других патогенов. В частности, этот подход успешно применялся для изучения развития гриппа и туберкулеза.