Риск заражения BA.5 среди людей, подвергшихся воздействию предыдущих вариантов SARS-CoV-2

В редакцию:

В последние месяцы омикрон (B.1.1.529) стал доминирующим вариантом тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2), демонстрируя некоторую степень уклонения от иммунитета.¹ Первичные подварианты омикрон, BA.1 и BA.2, постепенно вытесняются BA.5 во многих странах, возможно, из-за повышенной трансмиссивности и частичного уклонения от иммунитета, вызванного BA.1 и BA.2.^2,3 Защита, обеспечиваемая BA.1 от заражения подвариантом BA.5, имеет решающее значение, поскольку адаптированные вакцины в клинических испытаниях основаны на BA.1.

Португалия была одной из первых стран, затронутых доминированием BA.5. Мы использовали Национальный реестр коронавирусных заболеваний 2019 г. (Covid-19) (SINAVE) для расчета риска заражения BA.5 среди субъектов с документально подтвержденной инфекцией предшествующими вариантами, включая BA.1 и BA.2. Реестр включает все случаи, зарегистрированные в стране, независимо от клинической картины.

Фигура 1. Фигура 1. Защитный эффект предыдущей инфекции SARS-CoV-2 при заражении вариантом Omicron BA.5.

Как показано на панели (а), мы определили периоды (выделены разными цветами), когда один вариант был представлен более чем в 90% изолятов выборки (данные национального тяжелого острого респираторного синдрома коронавирус 2). [SARS-CoV-2] контроль генетического разнообразия⁴). Периоды, выделенные серым цветом, представляют периоды времени, когда в обращении находилось более одной переменной. Учитывая относительно медленный переход между доминированием варианта омикрон BA.1 и доминированием варианта омикрон BA.2, мы объединили BA.1 и BA.2 в анализе. Мы не включали субъектов, инфицированных в течение 90 дней до доминирования субфактора омикрон BA.5. На панели B показана эффективность защиты от инфекции в течение контрольного периода BA.5 (с 1 июня 2022 г.) среди субъектов с единичной инфекцией в периоды доминирования различных вариантов, как показано на панели A, по сравнению с субъектами без задокументированных случаев. заражения с 1 июня. В исследование не включались люди с инфекцией до 1 июня. 𝙸 Столбцы представляют 95% доверительные интервалы.

Национальный генетический надзор за SARS-CoV-2 выявил периоды, когда на разные варианты приходится более 90% изолятов.⁴ Мы определили всех субъектов, у которых была первая инфекция в контрольные периоды для каждой переменной, чтобы рассчитать их риск заражения в течение контрольного периода BA.5 (Рисунок 1а). Мы объединили BA.1 и BA.2 из-за медленного перехода между двумя подпеременными в популяции. Наконец, мы рассчитали риск BA.5 для популяции, у которой не было документально подтвержденной инфекции до доминирования BA.5 (1 июня 2022 г.).

Мы обнаружили, что предыдущая инфекция SARS-CoV-2 оказывала защитное действие против инфекции BA.5 (Рисунок 1б и Таблица S1 в дополнительном приложении, доступном с полным текстом этого письма на NEJM.org), и эта защита была максимальной для предыдущего заражения BA.1 или BA.2. Эти данные следует рассматривать в контексте пенетрантной инфекции среди высоковакцинированного населения, учитывая, что более 98% исследуемого населения в Португалии завершили серию первичных вакцинаций до 2022 г.

Дизайн исследования не может устранить все искажающие факторы (см. раздел обсуждения в дополнительном приложении). Кроме того, одним из ограничений является предполагаемый эффект снижения иммунитета в популяции с гетерозиготным иммунитетом (предшествующая инфекция и вакцинация). Мы обнаружили, что инфекция BA.1 или BA.2 у вакцинированных субъектов обеспечивала более высокую защиту от BA.5, чем инфекция преомикронными вариантами, что согласуется с недавним сообщением об отрицательном дизайне теста.⁵ Однако инфекции BA.1 или BA.2 происходили ближе к периоду доминирования BA.5, чем инфекции более ранними вариантами. Существует мнение, что защита, обеспечиваемая предыдущим заражением вирусом BA.1 или BA.2, очень низка, учитывая большое количество случаев заражения вирусом BA.5 среди лиц, ранее инфицированных вирусом BA.1 или BA.2. Наши данные предполагают, что такое восприятие, вероятно, является результатом большей группы субъектов с инфекцией BA.1 или BA.2 по сравнению с инфекцией другими субвариантами, и не подтверждается данными.

В целом, мы обнаружили, что проникающие инфекции с вариантом BA.5 были менее вероятными среди людей с предыдущей историей SARS-CoV-2 в высоковакцинированной популяции, особенно для предыдущих инфекций BA.1 или BA.2, чем среди неинфицированных субъектов. . . . .

Жоао Малато, Массачусетс.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Лиссабон, Португалия

Рой М. Рибейро, Фил Д.
Лос-Аламосская национальная лаборатория, Лос-Аламос, Нью-Мексико

Педро П. Лейте, доктор медицины
Педро Касака, доктор медицины
Евгения Фернандес, доктор философии.
Direção Geral da Saúde, Лиссабон, Португалия

Карлос Антунес, доктор философии.
Университет Лиссабона, Лиссабон, Португалия

Вальтер Р. Фонсека, доктор медицины, доктор философии.
Direção Geral da Saúde, Лиссабон, Португалия

Мануэль С. Гомес, доктор философии.
Университет Лиссабона, Лиссабон, Португалия

Луис Грака, доктор медицины, Фил Д.
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes, Лиссабон, Португалия
[email protected]

Это сообщение было опубликовано 31 августа 2022 года на сайте NEJM.org.